量化乳腺和卵巢瘤发生率限制的遗传变异
Kathleen E Houlahan1, Mahad Bihie2, Yves Greatti3
1Department of Human Genetics, University of California, Los Angeles, Los Angeles, CA, USA; Department of Medical Biophysics, University of Toronto, Toronto, Canada; Jonsson Comprehensive Cancer Center, David Geffen School of Medicine, University of California, Los Angeles, Los Angeles, CA, USA; Institute for Precision Health, University of California, Los Angeles, Los Angeles, CA, USA; Vector Institute, Toronto, Canada; Department of Medicine, Stanford University School of Medicine, Stanford, CA, USA; Department of Biochemistry and Biomedical Sciences, McMaster University, Hamilton, ON, Canada; Centre for Discovery in Cancer Research, McMaster University, Hamilton, ON, Canada.
删除,而不是单核酸变异,是引发乳腺癌和卵巢癌的关键驱动因素. 这一发现表明,在早期癌症检测策略中优先考虑删除测试.
科学领域:
- 在瘤学瘤学.
- 遗传学 是一个遗传学.
- 癌症基因组学 癌症基因组学
背景情况:
- 引发乳腺癌和卵巢癌的精确基因变异尚未完全理解.
- 生殖系BRCA1/2突变增加了癌症风险,但限制癌症发生率的遗传事件仍在争论中.
研究的目的:
- 估计乳腺和卵巢癌发病所需的驱动基因事件的最小数量和类型.
- 为了比较BRCA1/2携带者和非携带者之间的遗传改变,以确定关键的瘤发生事件.
主要方法:
- 根据发病率和突变数据,开发了一个统计框架来建模癌症发病率.
- 分析了3000多种乳腺和卵巢癌 (TCGA,METABRIC) 的体突变和副本数量数据.
- 使用进化时间和单细胞全基因组测序 (scWGS) 数据验证的发现.
主要成果:
- 删除,而不是单核酸变体 (SNVs),被确定为癌症发病的可能速度限制事件.
- 1-3个删除足以产生瘤,而单独的SNV无法解释观察到的发病率.
- BRCA1/2驱动和零星瘤具有相似的早期删除特征 (例如,13q,17),携带者会更快地积累它们.
结论:
- 与删除相关的染色体不稳定性可能是乳腺和卵巢癌的主要触发因素.
- 早期检测策略应侧重于删除作为潜在的生物标志物,因为它们比一些SNV更好地预测恶性进展.
