在液体活检中用于突变检测的非细胞DNA和细胞外膀衍生的DNA的预分析优化
Jonas Dohmen1, Lucrezia De Santis1, Bret M Stephens2
1Department of Surgery, University of Bonn, Germany.
Molecular oncology
|February 22, 2026
概括
在低于最佳的液体活检条件下,细胞外囊衍生DNA (evDNA) 比无细胞DNA (cfDNA) 具有更大的弹性. 标准化工作流程和快速处理对于可靠的瘤分析和监测至关重要.
科学领域:
- 分子诊断学 分子诊断
- 在瘤学瘤学.
- 生物化学 生物化学
背景情况:
- 液体活检提供非侵入性瘤分析和疾病监测.
- 预分析因素显著影响液体活检分析性能.
- 直接比较无细胞DNA (cfDNA) 和细胞外囊衍生DNA (evDNA) 的方法有限.
研究的目的:
- 为了前性地评估影响cfDNA和evDNA的预分析变量.
- 为了比较cfDNA与evDNA的稳定性和性能.
- 在液体活检中确定可靠突变检测的最佳条件.
主要方法:
- 对244名癌症患者的cfDNA和evDNA的处理延迟,储存温度,管类型和血体积的前性评估.
- 使用ddPCR,Qubit和TapeStation进行分析.
- 在723个存档的血样本中进行验证.
主要成果:
- 在不理想的条件下,evDNA表现出比cfDNA更大的弹性.
- 室温储存导致cfDNA在24小时后发生变化,evDNA在48小时后发生变化 (前性),或在回顾性分析中更早发生变化.
- 冷 (4°C) 保存的DNA质量比冷-80°C更好.
- 较高的血量可以改善evDNA突变检测,但不能改善cfDNA.
结论:
- 在临床液体活检应用中,标准化的工作流程和快速处理对于可靠的突变检测至关重要.
- 在具有挑战性的预分析场景中,evDNA可能比cfDNA具有优势.
- 优化预分析步骤对于最大限度地提高液体活检的临床效用至关重要.
