校准和记录两个密切相关的Wolbachia的宿主切换和不相容位的演变

科学领域:

• 微生物学和进化生物学
• 基因组学和生物信息学
• 关节动物内共生 关节动物内共生 关节动物内共生

背景情况:

• 母性遗传的沃尔巴基亚 (Wolbachia) 阿尔法蛋白细菌是常见的关节动物内共生生物.
• 由 cif loci 介导的细胞质不相容性推动了沃尔巴基亚的传播.
• 沃尔巴基亚-宿主协会和基因组进化的时间表是不确定的.

研究的目的:

• 为了校准Wolbachia的进化时间尺度,使用 filarial 线虫的密度融合.
• 调查沃尔巴基亚核心基因组和 cif loci. 的进化动态.
• 重新评估沃尔巴基亚传播和菌株间基因交换的估计.

主要方法:

• 用垂直遗传的沃尔巴基亚在 filarial 线虫中的基因学校准.
• 对与w Mel和w Ri相关的Wolbachia变种的基因组分析.
• 选择中的 cif loci 演变的比较分析.

主要成果:

• 核心Wolbachia位点主要是通过在1-200万年间的分叉进化.
• w 类似梅尔的沃尔巴基亚在2.1x10^5 - 2.4x10^6年前分离,居住在古代分离的宿主中.
• 之前对Wolbachia传播的估计被低估了7倍;CIF交换发生在10^4 - 10^6年内.

结论:

• 沃尔巴基亚基因组的进化在很长一段时间内在很大程度上发生了分化.
• 功能维护选择作用于完整的 cif loci.
• wMel变种显示出基于Wolbachia的生物控制策略的潜力.