自动化高通量蛋白质组学样本准备平台,使用工业微生物的DNA提取板
Zuoqing Zhang1,2, Manman Han1, Yujie Wang1
1Key Laboratory of Engineering Biology for Low-Carbon Manufacturing, Systems Biology Centre, Technical Support Core Facilities, Tianjin Institute of Industrial Biotechnology, Chinese Academy of Sciences, Tianjin 300308, China.
Analytical chemistry
|February 23, 2026
概括
我们为工业微生物开发了一种自动化蛋白质组学样本准备工作流程 (AutoDEP),大大提高了效率和可重复性. 这种高通量方法加速了细胞工厂设计和系统生物学.
科学领域:
- 微生物学 微生物学
- 蛋白质组学是指蛋白质组学.
- 生物技术是生物技术.
背景情况:
- 蛋白质组分析对于理解微生物系统和设计细胞工厂至关重要.
- 目前的方法是手动的,耗时的,昂贵的,容易出错的.
研究的目的:
- 为工业微生物开发一个自动化,高通量蛋白质组学样本准备工作流程 (AutoDEP).
- 为了提高效率,减少错误,加快蛋白质组数据生成.
主要方法:
- 基于二甲基硫酸盐 (SDS) 的溶解缓冲器与96井DNA提取板的整合.
- 使用了Biomek i7液体处理系统,从细胞溶解到生成完全自动化.
主要成果:
- 自动DEP实现了优异的样本准备效率,超过81%的零错过切割率.
- 在超过91%的蛋白质中,高可重复性被证明,内CV中位数低于7%,间CV低于20%.
- 日间可重复性显示皮尔森相关系数 (R2) 超过0.98.
- 工作流可以稳定地处理从5到200μg的蛋白质负载量.
结论:
- 自动DEP显著加快了使用工业底盘细胞构建细胞模型的速度.
- 工作流的强大性能表明了大规模研究的潜力,包括临床样本分析.


