一个高质量的染色体层次的基因组组装Gynostemma guangxiense (Cucurbitaceae)
Xiao Zhang1, Hao Zhang2, Chen Chen1
1Xi'an Botanical Garden of Shaanxi Province, Institute of Botany of Shaanxi Province, Xi'an, Shaanxi, 710061, China.
Scientific data
|February 23, 2026
概括
这项研究介绍了第一个高质量的染色体水平基因组Gynostemma guangxiense,一个有价值的药用植物. 这种基因组资源有助于理解其进化和保护,以便在未来开发.
科学领域:
- 基因组学就是基因组学.
- 植物科学 植物科学
- 医学植物学 医学植物学
背景情况:
- 甘花 (Gynostemma guangxiense) 是一种中国特有植物,属于科,具有显著的药用和健康潜力.
- 了解其遗传构成对于其保护和利用至关重要.
研究的目的:
- 为了生成高质量的染色体级基因组组合Gynostemma guangxiense.
- 为研究植物的适应性进化,遗传保护和药用应用提供基础资源.
主要方法:
- 整合了Illumina短读,PacBio HiFi长读,Hi-C和RNA-Seq的技术.
- 染色体的定和支架构建11个伪染色体.
主要成果:
- 一个565.18 Mb的基因组组合在11个伪染色体上,N50的支架为52.63 Mb.
- 高组装完整性 (98.00% BUSCO) 和识别了 27,527 个编码蛋白质的基因 (97.75% 功能注释).
结论:
- 现在可以获得G. guangxiense的染色体级基因组.
- 这种资源将促进对Gynostemma的进化,保护和其药用特性发展的研究.


