对SNP测序工作流程进行比较评估,以确定越南失踪人员的身份
Bethany K Forsythe1, Bas van Haperen1, Lisa Vangeel1
1International Commission on Missing Persons, The Hague, the Netherlands.
Forensic science international. Genetics
|February 24, 2026
概括
鉴定未识别的越南遗骸是具有挑战性的,因为退化的DNA. 有针对性的单核酸多态性 (SNP) 测序与优化的库准备提供了一个可行的解决方案,用于DNA识别.
科学领域:
- 法医科学 法医科学 法医科学
- 遗传学 遗传学 是一个
- 分子生物学分子生物学
背景情况:
- 数以十万计的越南冲突遗骸仍然未被识别.
- 由于DNA降解,微生物污染以及对参考样品的远亲的依赖,DNA鉴定受到阻碍.
- 线粒体DNA缺乏大规模识别的区分能力,标准的短串重复 (STR) 分析对退化的样本是不可行的.
研究的目的:
- 直接比较三个向单核酸多态化 (SNP) 测序工作流程,以识别高度降解的越南骨遗骸.
- 评估SNP面板 (MPSplex和FORCE) 的性能,使用不同的图书馆准备方法 (QIAseq和混合捕获).
主要方法:
- 来自未识别的越南遗骸的15个骨样本使用三个工作流程进行了处理:MPSplex-QIAseq,FORCE-QIAseq和FORCE-Capture.
- 模拟的家庭参考基因型被用于估计理论识别能力和工作流程性能.
- 采用了针对数千个SNP的大规模并行测序 (MPS).
主要成果:
- 这三种工作流都产生了SNP概况,理论上支持与四度亲属的识别.
- 在SNP恢复和理论识别能力方面,FORCE-Capture工作流显示出最高的性能.
- MPSplex-QIAseq显示了与FORCE-Capture相似的SNP恢复,但FORCE小组更大的SNP目标被证明是有利的.
结论:
- 有针对性的SNP测序,加上优化图书馆准备,是识别越南失踪人员的可行策略.
- 在识别退化的越南骨遗骸方面,FORCE-Capture工作流表现出卓越的性能.
- 在SNP测序技术的进步对于应对过去冲突中未识别遗骸的挑战至关重要.
