评估纳米孔适应性采样测序在检测平衡转位的效率
Meng Gao1,2, Jun Ren1,2, Cuiting Peng1,2
1Department of Medical Genetics/Prenatal Diagnostic Center, West China Second University Hospital, Sichuan University, Chengdu, Sichuan, China.
Journal of medical genetics
|February 25, 2026
概括
纳米孔适应性采样测序有效检测平衡转位 (BTs),为识别家族中的遗传风险提供了全基因组测序的经济有效替代方案. 这种方法改善了亚微观BT的检测,有助于遗传咨询.
科学领域:
- 基因组学就是基因组学.
- 基因诊断 基因诊断 基因诊断 基因诊断
背景情况:
- 均衡转位 (BTs) 增加了流产和异常后代的风险,这是由于不平衡的雌激素.
- 目前的基因测试错过了亚微观或复杂的BT.
- 全基因组长读测序是有效的,但成本高且数据密集型.
研究的目的:
- 评估纳米孔适应性采样测序用于检测BTs.
- 与现有方法相比,评估其成本效益和效率.
主要方法:
- 纳米孔适应性采样对外围血液的测序来自14名参与者在8个家庭怀疑BTs.
- 型和桑格测序用于断点确认.
主要成果:
- 适应性采样准确地确定了所有BT断点 (0.818 Mb).
- 在20X深度的500 kb侧边区域或15X深度的5 Mb时,检测效率高.
- 通过减少数据和成本,实现了与全基因组测序相似的深度.
结论:
- 纳米孔自适应采样测序提供了高分辨率,低成本的检测亚微观BTs.
- 它是一种实用的替代全基因组长读测序.
- 适用于临床工作流程,当预先测试表明BT区域时.


