可转移的元素-基因奇默地图,起源和增强转录组可塑性的作用
Youngseo Cheon1, Erik Glen Alvstad1, Denis Torre2
1Center for Epigenetics and Metabolism, Department of Biological Chemistry, School of Medicine, University of California, Irvine, CA, USA.
可转移元素 (TE) 集成到基因中,影响细胞状态和转录组可塑性. 一个新的RNA质量控制机制可以防止异常的TE表达和分化.
科学领域:
- 基因组学就是基因组学.
- 分子生物学分子生物学
- 表观遗传学 在表观遗传学中,表观遗传学是指表观遗传学.
背景情况:
- 可移植元素 (TE) 构成了人类基因组的很大一部分,起源于古代的寄生虫感染.
- 它们的重复性在研究它们的定位身份和调节功能方面提出了挑战.
- 关于TE如何融入基因及其功能影响的知识有限.
研究的目的:
- 研究将可转移元素集成到基因中的时间,位置和机制.
- 描述TE衍生异型物种跨物种的演化及其与基因调节网络的联系.
- 确定控制TE表达的新机制及其对细胞过程的影响.
主要方法:
- 长读序列和多维转录分析的整合.
- 在老鼠和人类基因组中对TE衍生异型的比较分析.
- 研究TE元素与控制细胞状态的基因调控网络之间的联系.
主要成果:
- 转基因被整合到基因中,影响跨物种的异构体.
- TE衍生异型与控制分化,器官生成,衰老和疾病的基因调节网络有关.
- 确定了一种新的依赖RNA降解和拼接的质量控制机制.
- 这种机制独立于DNA甲基化和异染色体化而运作.
- 它阻止了TE - 嵌合体转录的表达和TE - 诱导的细胞分化.
结论:
- 可转移的元素通过新的集成机制,有助于转录组的可塑性.
- 一个以前未知的质量控制途径调节TE表达,与表观遗传沉默不同.
- 这些发现揭示了病毒衍生元素如何增强细胞适应性和基因调节.
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