在2015-2017年和2022-2024年,荷兰对抗卡巴因的Acinetobacter baumannii进行基因组比较监测
Max P Allewijn1, Sandra Witteveen1, Karuna E W Vendrik1
1Centre for Infectious Disease Control (CIb), National Institute for Public Health and the Environment (RIVM), Bilthoven, the Netherlands.
2015-2024年期间,荷兰的抗卡巴胺抗性菌 (CRAb) 保持了基因稳定,但国际引入,特别是来自乌克兰的引入,增加了基因聚类和改变了抗性基因的流行率. 持续的监控至关重要.
科学领域:
- 基因组学就是基因组学.
- 流行病学 流行病学
- 微生物学 微生物学
背景情况:
- 耐卡巴胺的巴曼尼菌 (Acinetobacter baumannii,简称CRAb) 构成了严重的全球健康威胁.
- 了解CRAb的基因组流行病学对于有效的控制策略至关重要.
- 荷兰CRAb的以前监测数据有限.
研究的目的:
- 在两个不同的监测期间 (2015-2017年和2022-2024年) 调查荷兰CRAb的基因组流行病学.
- 确定高风险的CRAb血统并评估国际引入的影响.
- 为了比较荷兰CRAb的基因组和抗体简介与国际隔离物,包括来自乌克兰患者的隔离物.
主要方法:
- 分析了204个CRAb分离物,使用了卡巴胺无活化方法,梅罗胺测试和全基因组测序 (Illumina和Nanopore).
- 对抗组,多位序列类型 (MLST) 和全基因组MLST (wgMLST) 的比较分析.
- 与577个国际CRAb基因组进行比较.
主要成果:
- 荷兰的CRAb种群保持了基因多样性和稳定性,以国际克隆 (IC) 为主2.
- 在2022-2024年观察到增加的遗传集群,与乌克兰患者相关的独特集群.
- blaNDM基因的流行率增加,而乌克兰CRAb分离物中含有blaOXA-23类和blaOXA-24类基因,但没有blaNDM.
结论:
- 荷兰的CRAb在一段时间内表现出遗传稳定性,但国际品种的进口影响了流行病学.
- 新德里金属β-乳糖酶-碳基酶 (NDM) 的出现和来自高风险地区的菌株的引入需要持续的国家监测.
- 医疗保健专业人员必须意识到高患病率国家的住院住院和潜在的CRAb传播相关的风险.
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