结直肠癌的预后特征和免疫微环境特征基于与白血素相关的基因
Jinzhong Cao1, Shaohua Hou2, Zijing Wang1
1First Clinical Medical College, General Hospital of Ningxia Medical University, 804 Shengli Road, Yinchuan 750004, China; Ningxia Key Laboratory of Stem Cell and Regenerative Medicine, Institute of Medical Sciences, General Hospital of Ningxia Medical University, Ningxia Hui Autonomous Region, Yinchuan 750004, China.
一个使用介质蛋白相关基因 (IRG) 的新预后模型有效预测结直肠癌存活率和瘤微环境状态. 该模型识别出不同的免疫炎症或免疫感冒表型,有助于风险分层,以获得更好的治疗策略.
科学领域:
- 在瘤学瘤学.
- 免疫学 免疫学 免疫学
- 基因组学就是基因组学.
背景情况:
- 大肠直肠癌 (CRC) 在预后上显示出显著的变化.
- 目前的治疗方法,如免疫检查点抑制剂,对具有特定遗传特征 (dMMR/MSI-H) 的小部分患者 (10-15%) 有好处.
- 迫切需要准确的工具来根据生物见解对患者的风险进行分类.
研究的目的:
- 开发和验证一种新的结直肠癌 (CRC) 预后模型.
- 在CRC中基于互白素相关基因 (IRG) 识别分子亚型.
- 描述与不同风险群体相关的瘤免疫微环境.
主要方法:
- 来自TCGA-COAD/READ和GEO-GSE39582队列 (1209例) 的综合转录和临床数据.
- 利用共识聚类来定义分子亚型和LASSO-Cox回归来构建使用12个IRG的预后风险评分模型.
- 使用CIBERSORT,ssGSEA和ESTIMATE评估了免疫流体微环境;通过qPCR,IHC和siRNA敲击评估了IL20RB表达和功能.
主要成果:
- 预后模型对整体存活期 (OS) (AUC 0.629-0.684) 的预测准确度很好.
- 风险得分独立预测了预后,即使经过对TNM阶段和年龄进行调整.
- 高风险组:"免疫冷,富有肌体"的表型 (M2巨细胞,中性粒细胞). 低风险组:"免疫炎症"表型 (CD8+T细胞,NK细胞).
- 在CRC中IL20RB过度表达,其敲击抑制了细胞增殖,迁移和入侵.
结论:
- 建立了一个基于IRG的CRC诊断模型,能够预测OS并区分"热"和"冷"瘤.
- 过度表达的IL20RB与"免疫寒冷,富有瘤"的表型有关,在CRC进展中起着功能性作用.
- 这些发现为研究CRC中的IL相关途径和开发向治疗提供了基础.
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