综合多态学和机器学习确定ID1作为与腹腔大动脉动脉瘤相关的候选基因
Feng Guo1, Michael Keese2, Yu Zhao1
1Department of Vascular Surgery, The First Affiliated Hospital of Chongqing Medical University, Chongqing 400016, China.
Current issues in molecular biology
|February 27, 2026
概括
研究ID1在腹腔大动脉瘤 (AAA) 中的作用,这项研究发现低ID1表达与免疫细胞变化和细胞外矩阵重塑有关,表明ID1是潜在的治疗标.
科学领域:
- 血管生物学 血管生物学
- 免疫学 免疫学 免疫学
- 基因组学就是基因组学.
背景情况:
- 腹腔大动脉瘤 (AAA) 是一种危及生命的血管疾病,其特征是免疫系统失衡和细胞外矩阵 (ECM) 崩.
- 确切的AAA病变发生的分子驱动因素仍然不完全理解.
研究的目的:
- 阐明ID1在AAA发展中的机械作用.
- 通过多omics和机器学习来识别AAA干预的潜在分子标.
主要方法:
- 使用差异表达式,WGCNA和机器学习 (LASSO,随机森林,SVM-RFE) 对两个批量转录数据集 (GSE232911,GSE183464) 的整合分析.
- 使用ssGSEA和CIBERSORT进行了免疫透分析.
- 使用单细胞RNA测序数据验证发现 (GSE226492).
主要成果:
- 在独立数据集中,ID1在AAA中始终被确定为显著下调的基因,显示出强大的区分能力 (AUC = 0.939和0.868).
- 低ID1表达与增强的适应性免疫反应,增加的M1巨细胞,γδ T细胞和记忆B细胞相关,以及中性粒细胞和巨细胞活性降低.
- 单细胞分析证实了ID1下调,特别是在AAA组织内的内皮细胞和纤维细胞中.
结论:
- ID1被确定为一个关键的候选基因,涉及AAA特征的血管免疫重塑和ECM相关途径.
- 这些发现为进一步研究ID1在AAA病变发生过程中的特定分子机制及其作为治疗点的潜力提供了基础.
