基于转录组的选择和验证基因基因表达分析的基因基因表达在"罗格尼利亚·西里里斯" (Roegneria ciliaris) "Liao Sheng"在各种组织和干旱压力下

科学领域:

• 植物科学 植物科学
• 分子生物学分子生物学
• 遗传学 是一个遗传学.

背景情况:

• 罗格纳里亚 (Roegneria ciliaris) 是中国的一种有价值的多年性野生小麦,用于料和生态恢复.
• 它的强烈耐压力,早期生长和口感使其在生态和农业上具有重要意义.

研究的目的:

• 识别和验证稳定参考基因 (RGs) 用于使用qRT-PCR在R. ciliaris中进行准确的基因表达分析.
• 为了促进对R. ciliaris.干旱耐受机制的理解.

主要方法:

• 从干旱压力下的R. ciliaris的转录组数据中选择了八个候选RG.
• 通过使用五种算法 (∆Ct,geNorm,NormFinder,Bestkeeper,ReFinder) 在各种组织和干旱条件中评估RG表达稳定性.

主要成果:

• MDH和RPL19被确定为最稳定的RGs.
• GAPDH和TUBA表现出最不稳定的表达.
• 经过验证的RG准确地规范了pyrroline-5-carboxylate synthase (P5CS) 和蛋白酸酶2C (PP2C) 基因表达,与转录组数据一致.

结论:

• 这项研究提供了首次对R. ciliaris中的qRT-PCR参考基因稳定性的系统评估.
• 确定的稳定基因组将加强对R. ciliaris.组织特异性基因表达和干旱耐受机制的研究.