总编辑驱动的功能性基因组学:在后基因组时代将基因型与表型相结合
Syeda N Begum1, Syed K Hasan1,2
1Hasan Laboratory, Advanced Centre for Treatment, Research and Education in Cancer (ACTREC), Tata Memorial Centre, Navi Mumbai 410210, India.
主编辑通过系统地表征数千个遗传变异,使精确,高通量功能基因组学成为可能. 这项技术通过弥合基因型与表型之间的差距,推进了遗传疾病的诊断和治疗.
科学领域:
- 基因组学就是基因组学.
- 分子生物学分子生物学
- 基因工程是一种基因工程.
背景情况:
- 后基因组时代已经产生了大量的人类遗传变异数据,但大多数变异仍然没有特征,阻碍了临床应用.
- 目前的功能基因组学方法,如CRISPR-Cas9屏幕,无法有效评估单核酸变体 (SNV).
- 弥合基因型与表型之间的差距需要高通量,精确的功能基因组学工具.
研究的目的:
- 审查功能基因组学屏幕的演变,从基因级淘汰到高级变体表征.
- 突出主要编辑作为系统变异功能分析的转化平台.
- 详细介绍主要编辑系统,它们的机制,优化和交付方法.
主要方法:
- 基于CRISPR-Cas9的方法的审查,包括淘汰,CRISPR干扰/激活 (CRISPRi/a) 和多重测定变异效应 (MAVEs).
- 讨论针对性基因修改的基础编辑器和主要编辑.
- 对和基因组编辑 (SGE) 方法的分析.
主要成果:
- 主编辑使成千上万的基因变异能够以高精度进行系统的功能性表征.
- 这项技术克服了先前在评估国有企业和小企业方面的方法的局限性.
- 主编辑系统在架构,机制和交付方面经历了渐进的优化.
结论:
- 主编辑代表了功能基因组学的新范式,可以在规模上准确地表征变异.
- 这项技术有望加速遗传疾病的诊断和治疗.
- 使用原始编辑对变异的系统功能分析将促进精准医学的发展.
更多相关视频
08:25Using a Fluorescent PCR-capillary Gel Electrophoresis Technique to Genotype CRISPR/Cas9-mediated Knockout Mutants in a High-throughput Format
Published on: April 8, 2017
07:31Efficient PAM-Less Base Editing for Zebrafish Modeling of Human Genetic Disease with zSpRY-ABE8e
Published on: February 17, 2023
相关概念视频
Pharmacogenomics: Identification of New Drug Targets
Genomics
Genetic Screens
Forward genetic screens
Forward or “classical” genetic screens involve creating random mutations in an organism’s DNA using radiation, mutagens, or insertion of additional bases, which...
Pharmacogenetics and Pharmacogenomics: Overview
Pharmacogenetic Phenotypes: Alterations in Pharmacokinetics, Drug Targets and Biologic Milieu
CRISPR
