结肠直肠癌中的微生物组-基因组交叉:在流行病学,驱动器选择和翻译方面,可利巴克签名和菌核
Sungwon Jung1,2
1Department of Genome Medicine and Science, Gachon University College of Medicine, Incheon 21565, Republic of Korea.
International journal of molecular sciences
|February 27, 2026
概括
科利巴克是一种来自大肠杆菌的基因毒素,它会导致与结直肠癌 (CRC) 相关的特定DNA突变,并影响瘤的发展. Fusobacterium nucleatum也对CRC产生影响,影响治疗反应.
科学领域:
- 微生物组-基因组学
- 癌症生物学 癌症生物学
- 分子流行病学分子流行病学
背景情况:
- 科利巴克丁是一种来自pks+大肠杆菌的基因毒素,在结肠直肠癌 (CRC) 中会诱导明显的突变特征 (SBS88,ID18).
- 这些签名在癌症和正常的结肠组织中都被观察到,这表明在瘤进化过程中早期的印记.
- Fusobacterium nucleatum也在CRC中发挥作用,影响瘤生态和对微观卫星稳定 (MSS) CRC中的化疗和抗PD-1治疗等疗法的反应.
研究的目的:
- 研究CRC中微生物组-基因组相互作用的机械,基因组和分子流行病学证据.
- 建立用于检测微生物诱导的突变特征的分析标准.
- 探索对CRC的非侵入性查,风险分层和有针对性的微生物干预的翻译应用.
主要方法:
- 种群规模的基因组分析以识别和量化突变特征 (SBS88,ID18).
- 全基因组测序 (WGS) 和全外基因组测序 (WES) 用于签名检测.
- 概率归因建模,以评估大肠杆菌素对驱动器突变的贡献.
主要成果:
- 科利巴克丁突变特征在早期发病的CRC中得到丰富,并且显示出地理差异.
- 科利巴克导致了可测量的APC驱动突变在胆杆菌素阳性癌症.
- Fusobacterium nucleatum证明了对CRC瘤生态和治疗反应的类特异性影响.
结论:
- 微生物组-基因组交叉是CRC发展和进展的一个重要因素.
- 标准化的签名检测方法对于临床应用至关重要.
- 包括非侵入性查和微生物向治疗在内的转化策略对CRC的精密瘤学具有前景.
