一个基于长非编码RNA的分类器,用于识别具有高FGFR3活性的更具侵略性的低度Ta膀癌

科学领域:

• 在瘤学瘤学.
• 基因组学就是基因组学.
• 分子生物学分子生物学

背景情况:

• 非肌肉侵入性膀癌 (NMIBC) 的分类需要改进风险分层.
• 低度,Ta (TaLG) 阶段的NMIBC可以表现出侵略性行为,导致复发或进展.
• 之前的研究已经确定了长非编码RNA集群2 (LC2) 作为攻击性TaLG NMIBC的标志物.

研究的目的:

• 开发和验证单个样本转录组分类器,用于识别TaLG NMIBC中的攻击性LC2子组.
• 评估LC2分类器在预测无复发存活率方面的预后意义.
• 了解与LC2亚组相关的生物学途径.

主要方法:

• 使用UROMOL队列 (n=276) 进行培训和Hurst队列 (n=72) 进行验证.
• 通过中位数绝对偏差和嵌套交叉验证使用的特征选择.
• 训练了一种具有十倍交叉验证的弹性净回归模型,并使用路径分析,卡普兰-梅尔和考克斯回归来评估性能.

主要成果:

• 该分类器成功识别了LC2瘤,在赫斯特队列中检测到7/72例病例.
• 在LC2-TaLG患者中,没有复发的生存率显著降低 (log-rank p < 0.001).
• LC2状态是复发的强有力的预测因素 (HR4.52,p=0.001),LC2预测的瘤显示出一致的生物模式.

结论:

• 一个可复制的单个样本转录组分类器已经开发出来,用于攻击性TaLG NMIBC.
• 该分类器显示了识别患有复发风险较高的患者的潜力.
• 进一步验证可以支持NMIBC管理的临床决策.