全基因组双硫酸盐测序识别了肝细胞癌的基于血液的DNA甲基化生物标志物
Junsheng Zhao1,2, Sijia Shen1, Junjie Zhang2
1State Key Laboratory for Diagnosis and Treatment of Infectious Diseases, National Clinical Research Center for Infectious Diseases, National Medical Center for Infectious Diseases, Collaborative Innovation Center for Diagnosis and Treatment of Infectious Diseases, The First Affiliated Hospital, Zhejiang University School of Medicine, Hangzhou, China.
Molecular carcinogenesis
|March 1, 2026
概括
基因甲基化异常是癌症的关键. 研究人员确定了血中甲基化TSPYL5作为早期肝细胞癌 (HCC) 检测的有希望的生物标志物,达到85.4%的灵敏度和100%的特异性.
科学领域:
- 表观遗传学 在表观遗传学中,表观遗传学是指表观遗传学.
- 在瘤学瘤学.
- 生物标志物发现发现
背景情况:
- DNA甲基化异常是人类癌症的标志.
- 异常的甲基化模式为敏感的,非侵入性的癌症诊断提供了潜力.
- 特定区域的大量甲基化差异可以提高固体瘤的诊断准确性.
研究的目的:
- 使用血液样本识别甲基化标记物,用于对肝细胞癌 (HCC) 的非侵入性诊断.
- 整合全基因组双硫酸盐测序 (WGBS) 和mRNA-seq数据用于标记物发现.
- 验证在无细胞DNA (cfDNA) 中检测HCC的潜在生物标志物.
主要方法:
- 结合WGBS和mRNA-seq在33个配对的HCC和相邻组织上.
- 选择差异甲基化区域 (DMRs) 具有很大的甲基化差异 (Δβ > 0.3) 和逆基因表达相关性 (cor <-0.3).
- 在使用定量甲基化特异性PCR (qMSP) 来验证48名HCC患者和24名对照者的cfDNA中验证了候选标记物,特别是meTSPYL5.
主要成果:
- 使用集成的WGBS和转录基因数据分析识别了八个目标促销者超级DMR.
- 在外周血液单核细胞中确认了WGBS概况.
- 血cfDNA甲基化检测meTSPYL5显示了85.4%的灵敏度和100%的特异性用于HCC识别.
- 全癌症分析表明TSPYL5甲基化在多种癌症类型中升高,但对于HCC查仍然有价值.
结论:
- 综合性表观基因组和转录基因组分析有效地识别了人类癌症的诊断生物标志物.
- 八个地区被确定为HCC的潜在诊断生物标志物.
- 血中甲基化TSPYL5是高风险人群中HCC检测和查的一个有前途的生物标志物.
