对正在发育的斑马鱼和人类内皮的功能基因组学分析揭示了在脊椎动物器官发生过程中起作用的高度保守的cis调节模块
Daniela M Riley1, Randa Elsayed1, Mark D Walsh1
1University of Warwick.
Genome research
|March 4, 2026
概括
研究人员确定了保存的基因调节元素,控制了4亿年的进化过程中的内皮发育. 这些 cis调节模块 (CRM) 揭示了脊椎动物胰腺和神经系统发育的共同遗传程序.
科学领域:
- 发展生物学 发展生物学
- 进化生物学 进化生物学
- 基因组学就是基因组学.
背景情况:
- 脊椎动物表现出保存的形态和器官功能,尽管表面的多样性.
- 关键发育基因的保存解释了特征的维持,但需要类似的基因调节程序.
- 内皮胚胎层对于呼吸道,胃肠道,肝脏和胰腺发育至关重要.
研究的目的:
- 在脊椎动物进化过程中识别高度保守的内皮细胞调节模块 (CRMs).
- 了解控制内皮器官生成的调节机制.
- 定义CRMs对于神经胰腺基因控制和胚胎造型至关重要.
主要方法:
- 使用了功能性基因组学方法.
- 在4亿年间隔的物种 (斑马鱼和人类) 中进行了比较分析.
- 用转录因子结合点分析来描述CRM.
主要成果:
- 很少有特定于内皮的CRMs被确定;许多参与胰腺发育的CRMs也在神经系统中起作用.
- 保存的CRMs为神经胰腺转录因子的结合部位进行了丰富.
- 高度保守的CRMs显示转录因子结合点的共同发生模式,但不是刚性安排.
结论:
- 高度保存的CRMs提供了对脊椎动物内皮器官生成的见解.
- 这些CRM是理解神经胰腺基因调节和前胚胎模式的关键.
- 为未来的研究重点定义了一个保存CRM的汇编.
