在科学出版物中报告定量聚合酶连锁反应 (qPCR) 方法的质量

科学领域:

• 分子生物学分子生物学
• 遗传学 是一个遗传学.
• 植物科学 植物科学

背景情况:

• 复制性是科学研究中的一个关键问题,特别是对于复杂的技术,如定量聚合酶连锁反应 (qPCR).
• 定量实时PCR实验出版的最低信息 (MIQE) 准则是为了改善报告标准而制定的.
• 尽管存在MIQE,但qPCR报告中仍存在持续的缺陷,需要进一步评估.

研究的目的:

• 系统地评估最近发表的研究中qPCR报告的完整性和透明度.
• 确定QPCR实验的方法报告中存在的具体缺陷.
• 评估是否符合qPCR. 已确定的报告准则.

主要方法:

• 从顶级期刊使用qPCR对186篇遗传学/遗传学和246篇植物科学文章进行了系统审查.
• 对RNA质量控制,参考基因细节,RNA提取,cDNA合成和qPCR程序的报告完整性的评估.
• 报告缺陷频率的描述性分析.

主要成果:

• 在报告RNA完整性 (7-10%) 和评估方法 (14-16%) 中发现了重大遗漏.
• 参考基因的可追溯性有限,只有11% (遗传学) 和32% (植物学) 的研究提供了加入号码.
• 套件,目录号和用于RNA提取,cDNA合成和qPCR的试剂的关键细节经常缺失 (7-14%).

结论:

• 迫切需要改善qPCR的报告标准,以提高可复制性和数据可靠性.
• 更加重视质量控制,详细的试剂信息和分析透明度至关重要.
• 解决方案包括促进在线协议存储库,结构化报告模板和MIQE标准的自动合规工具.