使用下一代测序和定量蛋白质组学进行泛癌多原子ERBB2-HER2表征

科学领域:

• 在瘤学瘤学.
• 分子生物学分子生物学
• 基因组学就是基因组学.

背景情况:

• 目前FDA批准的HER2 (人类表皮生长因子受体2) 分子测试在识别可能受益于HER2向治疗的患者方面存在局限性.
• 这在瘤被归类为HER2阴性但仍对HER2向药物有反应的情况下是显而易见的,这表明需要改进诊断方法.

研究的目的:

• 调查目前针对HER2向治疗的诊断方法的局限性.
• 在晚期泛癌固体瘤中对DNA,RNA,蛋白质和蛋白水平的ERBB2/HER2激活的特征.
• 评估基因组变化与下游 HER2/EGFR 信号激活之间的一致性.

主要方法:

• 综合的多原子分析,将临床下一代测序 (NGS) 与CLIA认证的逆相蛋白阵列 (RPPA) 测试相结合.
• 用激光微切割丰富的瘤样本用于全面的表征.
• 使用RPPA进行功能通路激活映射.

主要成果:

• 确定了ERBB2基因组/转录组变异或HER2^总阳性,缺乏显著的HER2^Y1248激活的患者.
• 在没有ERBB2基因组/转录组变化的患者中观察到显著的HER2^Y1248激活,与EGFR^Y1173的协同激活.
• 在ERBB2基因组/转录组状态和下游HER家族信号激活之间显示出弱一致.

结论:

• 蛋白质和蛋白质分析对于准确识别那些将受益于HER2和EGFR向治疗的患者至关重要.
• 目前的基因组和转录组测试本身不足以指导精密瘤学的治疗选择.
• 功能性蛋白质和蛋白质分析应整合到精密瘤管道中,以改善患者分层.