在实验室中使用肠道有机体对与年龄相关的甲基化变化进行建模

科学领域:

• 衰老的研究研究.
• 表观遗传学 在表观遗传学中,表观遗传学是指表观遗传学.
• 干细胞生物学 干细胞生物学

背景情况:

• 肠道器官是来自肠道干细胞的先进3D培养物,为衰老研究提供了一个有前途的模型.
• 基因甲基化作为生物衰老的关键生物标志物.
• 这项研究研究了有机DNA甲基化对衰老研究的有用性,通过将其与初级肠道上皮相比较.

研究的目的:

• 为了比较肠道有机体中的DNA甲基化模式与初级衰老肠道表皮的模式.
• 为了确定有机DNA甲基化是否可以准确地反映衰老过程.
• 探索有机体在研究影响与年龄相关的DNA甲基化因素方面的潜力.

主要方法:

• 对肠道有机体和初级肠道表皮的全基因组DNA甲基化分析.
• 在体内和体外模型之间的甲基化模式的比较.
• 线性建模以评估有机体的衰老速度.
• 用DNA甲基化抑制剂德西他治疗有机体.

主要成果:

• 在有机体培养过程中观察到显著的DNA甲基化变化,CpG部位的27%显示低甲基化,11%显示高甲基化.
• 在有机体中超甲基化主要影响CpG岛屿,并与体内观察到的与年龄相关的甲基化变化相关.
• 来自老年小鼠的早期过渡器官保留了老化特异性的甲基化模式,并且器官在培养中表现出每周大约2周的老化率.
• 低甲基化发生在与衰老无关的区域,与体内衰老或分化无关.

结论:

• 在有机体中,DNA甲基化变化代表了衰老 (CpG岛屿高甲基化) 和单独的随机低甲基化过程.
• 有机体显示出作为研究与年龄相关的DNA高甲基化外在影响的模型的潜力.
• 德西塔治疗减少了有机体的甲基化年龄,突出了它们对干预研究的有用性.