评估城市沟,以追踪巴西东南部低卫生条件地区的SARS-CoV-2

科学领域:

• 环境微生物学环境微生物学
• 流行病学 流行病学
• 病毒学 病毒学
• 公共卫生监督 公共卫生监督

背景情况:

• 基于废水的流行病学 (WBE) 已成为监测传染病的关键工具,包括SARS-CoV-2.
• 之前的研究集中在污水处理厂 (STP),但其他水体的实用性,如城市沟的监测仍然未被充分探索.
• 了解SARS-CoV-2在各种水生环境中的存在对于全面的公共卫生监测至关重要.

研究的目的:

• 在城市沟中检测SARS-CoV-2RNA并评估它们作为流行病监测样本采集地点的适用性.
• 评估城市沟和STP中的SARS-CoV-2病毒载量与确诊的COVID-19病例的流行病学数据之间的相关性.
• 为了比较城市沟与STP的有效性,作为WBE的采样点.

主要方法:

• 在2021年1月至2022年2月期间,从巴西圣埃斯皮里托州维托里亚的三个城市沟和两个STP收集168个水样.
• 分析水质的物理化学和微生物学参数.
• 使用TaqMan逆转录定量聚合酶链反应 (RT-qPCR) 检测和定量SARS-CoV-2RNA.

主要成果:

• 在87.2%的城市沟样本和85.3%的STP样本中检测到SARS-CoV-2RNA.
• 在沟中的病毒载量从1.59 × 10^4到2.56 × 10^4基因组拷贝/升 (GC/L) 之间,在STP中从7.79 × 10^3到1.26 × 10^4 GC/L之间.
• 在城市沟中的病毒载量和确诊的COVID-19病例之间观察到中等到强的正相关性 (r = 0.580.86),表明相关性高于STPs.

结论:

• 城市沟,特别是卫生水平较低的地区,是SARS-CoV-2流行病监测的有效和同等采样地点.
• 这些发现突出了利用城市沟用于WBE的潜力,补充了STP的数据.
• 这项研究支持WBE策略的扩展,包括城市沟,以进行强有力的传染病监测.