一个可扩展的,低成本的样本散列工作流程,用于使用Seq-Well S3平台进行多原子单细胞分析
Daniela D Russo1,2,3,4, Sarah L Quinn2,3,4, Olha Kholod5
1Department of Immunology, Harvard Medical School, Boston, MA, USA.
Nature protocols
|March 6, 2026
概括
本研究提出了一种简化方案,用于从低输入临床样本使用Seq-Well S3平台进行单细胞多原子分析. 该方法提高了数据质量和吞吐量,同时降低了研究人员的成本.
科学领域:
- 生物技术是生物技术.
- 基因组学就是基因组学.
- 细胞生物学 细胞生物学
背景情况:
- 临床样本为健康,疾病和治疗反应提供了深刻的见解.
- 单细胞样本需要专门的工作流程来最大限度地提高信息产量.
- 单细胞多组学现有的方法可能昂贵且技术要求很高.
研究的目的:
- 为从低输入样本生成和分析单细胞多原子数据提供详细的协议.
- 引入一个样本哈希管道,以减少成本和技术变化.
- 从具有挑战性的临床标本中获得高质量的多原子洞察力.
主要方法:
- 使用Seq-Well S3平台进行单细胞库生成.
- 包括可选的抗体-寡核酸染色用于细胞表面蛋白质定量和复合.
- 采用可选的大量RNA测序 (SMART-seq2) 进行遗传解复.
- 实现数据分析的计算管道.
主要成果:
- 一个简化和高效的单细胞多原子数据生成方法.
- 一个具有成本效益的样本散列策略,可以减少技术变化并增加吞吐量.
- 从低输入样本中获得的高质量的多原子数据.
结论:
- 提出的协议显著降低了研究人员的入境障碍.
- 这种方法可以从临床样本中快速生成高质量的多原子洞察力.
- 该方法可适应,并利用标准的实验室设备和试剂.
