伊拉克癌症患者血流感染多抗药性大肠杆菌的全基因组分析

科学领域:

• 传染性疾病 传染性疾病
• 基因组学就是基因组学.
• 在瘤学瘤学.

背景情况:

• 伊拉克瘤患者的血液感染因大肠杆菌的抗菌素耐药性而越来越难以治疗.
• 关于伊拉克癌症患者中大肠杆菌的抗菌素耐药性模式的数据有限.
• 大肠杆菌中抗菌素耐药性 (AMR) 的上升对免疫功能低下的癌症患者治疗感染提出了重大挑战.

研究的目的:

• 描述和比较来自伊拉克癌症患者的多药耐药 (MDR) 和抗生素敏感大肠杆菌分离物的抗菌素耐药性基因特征.
• 为在瘤学环境中提供数据,以告知感染控制和抗微生物药物管理策略.

主要方法:

• 在巴格达的三个瘤医院进行了前性多中心研究.
• 对55种大肠杆菌血流分离体进行表型敏感性测试 (VITEK® 2,磁盘扩散) (36种MDR, 19种敏感).
• 使用AMRFinderPlus.com进行全基因组测序 (Illumina MiSeq) 和抗菌素耐药性基因 (ARG) 的识别.

主要成果:

• 大肠杆菌的MDR分离体显示出广泛的抗体,主要由排泄系统 (100%检测) 主导.
• 鉴定了36种独特的ARG;常见的基因包括排泄,β-乳酸酶 (88.9%),宏化物 (66.7%),四环素 (55.6%) 和氨基糖化物 (41.7%) 的基因.
• 敏感分离物与MDR分离物共享有限的ARG核心组 (例如,排放,调节器),这表明需要额外的机制来实现高水平的抗性.

结论:

• 瘤学患者的MDR大肠杆菌具有密集的,流出驱动的抗体,增强了各种β-乳糖酶和其他耐药性决定因素.
• 对抗生素敏感的大肠杆菌保留了一组有限的耐药基因核心组.
• 癌症中心的基因组监测对于预测耐药性的出现和指导向的抗菌疗法至关重要.