转录组签名预测了严重的linezolid诱导的外周神经病变,并揭示了治疗前的免疫和抗氧化剂失调

科学领域:

• 基因组学和分子生物学
• 传染性疾病 传染性疾病
• 神经科学是一个神经科学.

背景情况:

• 莱涅佐利德对于多抗药结核病 (MDR-TB) 和广泛抗药结核病 (XDR-TB) 的治疗至关重要.
• 周围神经病变是一种常见的,潜在的不可逆转的副作用,限制了linezolid的长期使用.

研究的目的:

• 为了确定预测对线索利德诱导的外围神经病变易感性的生物因素.
• 了解患有不同程度神经病变的患者的转录组差异.

主要方法:

• 从51名MDR/XDR-TB患者的外周血液单核细胞 (PBMC) 的转录组分析,在线索利德治疗6个月前和后进行.
• 将患者分为无症状,轻度和重度神经病变组的分层.
• 机器学习 (ML) 模型开发使用SHAP值来确定特征的重要性.

主要成果:

• 患有严重神经病变的患者具有明显的基线转录特征,包括免疫失调和抗氧化剂防御功能受损.
• 这些患者在治疗期间表现出有限的转录反应,IL10的显著下调.
• 一个11基因的ML模型预测了严重的神经病变,交叉验证的AUC为0.93,突出显示HP和HSPA1B是关键预测因素.

结论:

• 严重的linezolid诱导的外围神经病变与先前存在的免疫和代谢变化有关.
• 经历严重神经病变的患者在线索利德治疗期间表现出不充分的全身反应.
• 这些发现可以为个性化治疗策略提供信息,以减轻结核病患者的神经病变风险.