使用全基因组序列分析从牛便中分离出的多种耐药细菌的病型,生物膜,病毒瘤和抗性组概况

科学领域:

• 微生物学 微生物学
• 基因组学就是基因组学.
• 公共卫生 公共卫生

背景情况:

• 腹疾病导致全球高死亡率,由抗菌素耐药性 (AMR) 的上升加剧.
• 牛是AMR生物体的重要储存库,通过食物链可能传播给人类.
• 了解牛中的细菌概况对于公共卫生风险评估至关重要.

研究的目的:

• 为了研究从无症状牛便中分离出来的细菌的病型,生物膜,病毒体和抗体.
• 识别和表征来自牛群的多抗药和生物膜形成细菌分离物.
• 评估这些分离物作为人类病原体的潜力.

主要方法:

• 采用全基因组测序 (WGS) 来分析来自牛便的三种多抗药,生物膜形成的细菌分离物 (DEC_NWU,DVC_NWU,DSS_NWU).
• 使用基因组分类数据库 (GTDB) 进行了细菌鉴定.
• 病原体寻找器被用来分类分离物,并分析了毒性和耐药性基因.

主要成果:

• 分离物被确定为大肠杆菌 (DEC_NWU),霍乱病毒 (DVC_NWU) 和S. enterica (DSS_NWU),与已知的人类病原体相关.
• 所有分离物被证实是多抗药性,强大的生物膜形成者,并被归类为人类病原体.
• 在所有测序的基因组中检测到病毒性因素 (粘附性,铁吸收,入侵性,毒素,分泌系统) 和多个抗性基因.

结论:

• 无症状的牛在便中藏和释放多药耐药的人类病原体.
• 这些与牛相关的细菌拥有大量的毒性和耐药性基因.
• 这一发现突出了关于潜在的食物链传染病原体的重大公共卫生问题.