进化动态和全球蔓延的抗类抗 Bordetella pertussis 在后流行性百日咳复苏期间的百日咳

科学领域:

• 微生物学 微生物学
• 基因组学就是基因组学.
• 流行病学 流行病学

背景情况:

• 百日咳 (百日咳) 在COVID-19大流行后全球复苏.
• 这种复苏的具体驱动因素,特别是Bordetella pertussis的基因组进化,仍然不清楚.

研究的目的:

• 研究 Bordetella pertussis 基因组进化对流行病后复苏的贡献.
• 分析基因型,抗原特征和宏类耐药性的时间动态.

主要方法:

• 分析了来自35个国家的8117个B.百日咳基因组.
• 包括来自中国六个地区的249个新测序的分离物.
• 在大流行之前,期间和之后检查基因型,抗原特征和类抗性的时间动态.

主要成果:

• 全球共享的B. pertussis进化模式包括宏类耐药菌株 (MR-MT28亚系) 的出现和主导,特别是在中国.
• 观察到并行抗原转移,PRN缺陷菌株减少,prn2等位基因频率增加.
• 区域特异性动态指出:中国的复兴是由MR-MT28推动的,而欧洲/美国则看到当地血统的持续存在. 在全球范围内,MR-MT28亚系正在多样化.

结论:

• 全球基因组分析揭示了B. pertussis的共同和特定区域的流行后转变.
• MR-MT28亚系在中国的主导地位,国际传播和多样化构成了公共卫生问题.
• 强调需要对百日咳进行全球协调的基因组监测.