精确且具有成本效益的工作流程整合了三组聚合的WES,用于在神经发育障碍中发现新基因
Lucía López-López1, Laura Lapeña-Gil1, Yolanda Benítez1,2,3
1Department of Genetics & Genomics, Health Research Institute-Fundación Jiménez Díaz University Hospital, Universidad Autónoma de Madrid (IIS-FJD, UAM), Madrid, Spain.
使用聚合DNA全外体测序 (WES) 的新诊断工作流改善了神经发育障碍 (NDD) 的遗传诊断. 这种具有成本效益的方法可以识别新的基因,并在具有挑战性的病例中提高诊断产量.
科学领域:
- 遗传学 是一个遗传学.
- 神经科学是一个神经科学.
- 分子生物学分子生物学
背景情况:
- 神经发育障碍 (NDD) 由于遗传异质性而存在重大诊断挑战.
- 在三组设计中,全外体测序 (WES) 对于检测NDD中的de novo变体是有效的,但往往成本过高.
- 以前的向测序未能诊断出大量患有综合征性NDD的个体.
研究的目的:
- 评估一个连续的诊断工作流程,整合单独和聚合三组全外体测序 (WES) 进行NDDs.
- 评估这种新方法的诊断产量和成本效益.
- 确定与综合征性NDD相关的新型候选基因.
主要方法:
- 一组221名患有综合征性NDD和先前负面向测序的个体接受了连续的WES工作流.
- 工作流涉及最初的单独WES,随后使用组合的父母DNA (trio pooled-WES) 进行三组WES.
- 进行了DNA聚合策略的优化和验证.
主要成果:
- 顺序工作流实现了20.98%的整体诊断产量.
- 在患有NDD的个体中,发现了13个新型候选基因.
- 三组聚合WES的诊断能力与传统的三组WES相比,成本较低.
结论:
- 实施的顺序诊断工作流程是NDDs遗传诊断的临床适用和具有成本效益的策略.
- 三组聚合WES为传统的三组WES提供了可行的替代方案,提高了NDD遗传诊断的可访问性.
- 这种方法有助于发现导致NDDs的新遗传因素.
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