机器学习驱动的多奥米克分析确定CHP2是结肠直肠癌中关键的PANoptosis相关的双重功能生物标志物
Zetian Zhang1, Xingyu Jiang1, Xin Zhang1
1The Key Laboratory of Zoonosis, Department of Pathogen Biology, Chinese Ministry of Education, College of Basic Medical Sciences, Jilin University, Changchun 130000, China.
Cells
|March 14, 2026
概括
氨酸B同源蛋白2 (CHP2) 是结肠直肠癌 (CRC) 的新生物标志物. 较低的CHP2表达表明预后不好,耐化疗,但对向疗法的敏感性,使得个性化CRC治疗.
科学领域:
- 在瘤学瘤学.
- 分子生物学分子生物学
- 生物信息学是一种生物信息学.
背景情况:
- 结肠直肠癌 (CRC) 的异质性带来了重大的治疗挑战.
- 识别新的生物标志物对于CRC个性化治疗策略至关重要.
研究的目的:
- 使用多组学和机器学习识别和验证结直肠癌 (CRC) 的核心候选生物标志物.
- 阐明已识别的生物标志物在CRC进展和治疗反应中的功能作用.
主要方法:
- 集成的multiomics数据与机器学习算法.
- 使用SHAP模型进行临床解释.
- 通过体外和斑马鱼模型验证的发现.
主要成果:
- 确定了氨酸B同源蛋白2 (CHP2) 作为核心候选生物标志物.
- 在CRC中发现CHP2表达的减少,与预后不佳和"冷"的瘤免疫微环境 (TIME) 相相关.
- 证明CHP2过度表达通过诱导PANoptosis来抑制CRC细胞生长和入侵.
结论:
- CHP2作为双重功能生物标志物,预测CRC的生存和预测治疗反应.
- 通过CHP2表达特征,可以识别高风险患者,这些患者对标准化疗有耐药性,但对向抑制剂敏感.
- CHP2具有引导药物耐药CRC个性化治疗方法的潜力.
