对胃肠道移植与宿主疾病的基于组织的转录基因分析揭示了免疫和微RNA失调

科学领域:

• 免疫学 免疫学 免疫学
• 胃肠病学 胃肠病学
• 分子生物学分子生物学

背景情况:

• 胃肠道急性移植对宿主疾病 (GI aGvHD) 是异构造血型干细胞移植 (HSCT) 后死亡的主要原因.
• 目前用于GI aGvHD的诊断方法是侵入性的,缺乏敏感性.
• 受aGvHD影响的胃肠道组织中的本地转录基因格局尚不清楚.

研究的目的:

• 从具有和没有GI aGvHD的HSCT患者的GI活检中描述综合mRNA和microRNA表达特征.
• 为了确定特定疾病的分子特征和GI aGvHD.潜在的诊断生物标志物.
• 为了获得关于GI aGvHD病变的组织特异性见解.

主要方法:

• 在使用NanoString nCounter技术的8名HSCT患者 (3名有GI aGvHD,5名没有) 结肠镜切除的GI活检中,对mRNA和microRNA表达的综合分析.
• 分析了770个与免疫相关的mRNA和799个成熟的人类微RNA.
• 不同表达分析,途径丰富,细胞类型解卷和机器学习用于生物标志物优先排序.

主要成果:

• 胃肠道aGvHD组织显示出炎症基因 (例如IL1B,IL17RA) 和免疫调节微RNA (例如miR-155-3p,miR-223-3p) 的调节.
• 观察到表皮和抗炎标记物 (例如ST6GAL1,THBS1) 和微RNA (例如miR-1915-3p,miR-145-5p) 的下调.
• 丰富分析显示IL2 / STAT5,JAK / STAT3,TCR信号和抗原呈现途径被激活;顶级生物标志物候选者包括LCN2,CXCL13和miR-1269b. 观察到M0巨细胞增加和树突细胞减少.

结论:

• 这项研究提供了第一个使用NanoString技术在aGvHD中GI组织的综合mRNA和microRNA分析.
• 研究结果揭示了免疫路径的失调,骨髓状细胞种群的改变,以及GI aGvHD的新型组织特异性生物标志物候选者.
• 需要进一步的验证研究来证实已识别的生物标志物的临床实用性,并了解aGvHD的病原性.