基于DNN的半参数AFT模型,用于将基因组和病理成像数据整合到癌症预后中
Jingmao Li1, Qingzhao Zhang2,3, Shuangge Ma1
1Department of Biostatistics, Yale School of Public Health, New Haven, CT 06520, United States.
Biometrics
|March 16, 2026
概括
这项研究引入了一种用于癌症预后的新型半参数模型,使用深度学习集成基因组和成像数据. 该方法提高了预测准确度,并确定了肺癌的关键预后因素.
科学领域:
- 生物统计学 生物统计学
- 计算生物学 计算生物学
- 医疗信息学 医疗信息学
背景情况:
- 预后建模在癌症研究和临床实践中至关重要.
- 基因组和病理成像数据为癌症预后提供了互补的见解.
- 整合不同的数据类型可以提高癌症结果预测的准确性.
研究的目的:
- 为癌症预后开发一个先进的半参数加速失效时间模型.
- 有效地整合高维基因组和病理成像数据.
- 提高癌症预后模型的解释性和灵活性.
主要方法:
- 开发了一种半参数加速失效时间模型.
- 用于可解释的基因组数据的参数效应和用于成像数据的非参数效应 (深度神经网络).
- 应用惩罚技术,包括对深度神经网络权重的群体惩罚,用于变量选择.
主要成果:
- 建立了理论性质,包括非对称选择和估计一致性和正常性.
- 通过模拟证明了竞争性表现.
- 在癌症基因组图谱 (The Cancer Genome Atlas) 肺癌数据分析中取得了令人满意和合理的发现,表现优于替代品.
结论:
- 拟议的半参数模型有效地整合了基因组和病理成像数据,以改善癌症预后.
- 深度神经网络增强复杂的成像特征的建模.
- 该方法为癌症结果预测提供了一个强大的框架,具有强大的理论依据.
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