脊椎动物3酸脱酶伪基因的异常丰富性

科学领域:

• 生物化学 生物化学
• 分子生物学分子生物学
• 进化遗传学 进化遗传学

背景情况:

• 甘-3-酸盐脱酶 (GAPDH) 是糖解中的一个关键酶.
• 在人类,小鼠,老鼠和中已知有一个单一的功能GAPDH基因.
• GAPDH基因定位不同,人类的染色体12和小鼠的染色体6不同.

研究的目的:

• 为了研究不同物种中GAPDH相关序列的副本数变异.
• 根据GAPDH基因的重复水平来分类生物.
• 探索GAPDH基因放大对进化的影响.

主要方法:

• 用克隆的GAPDHcDNA探针进行基因组DNA斑点分析.
• 在各种物种中对GAPDH序列重复水平的比较分析.
• 生物体根据副本编号分类为组.

主要成果:

• 观察到与GAPDH相关的序列副本数量存在显著差异,从1到200多个副本.
• 生物被分为三个类别:独特的代表性 (),低的重复性 (人类,子,豚鼠,仓鼠的10-30个副本) 和高的重复性 (>200个副本在小鼠,老鼠).
• 在小鼠和老鼠中高重复类代表了对酶编码基因的前所未有的发现.

结论:

• 这项研究揭示了GAPDH基因家族大小的实质性进化差异.
• 与GAPDH相关的序列的主要基因放大事件可能发生在15-25万年前.
• 在动物中这种极端放大提供了对基因重复和伪基因形成的见解.