一个具有N端核的蛋白质催化框架能够自我激活

科学领域:

• 生物化学 生物化学
• 结构生物学 结构生物学
• 酶学 是一种酶学.

背景情况:

• 已经确定了三种氨基基酸酶的晶体结构 (谷氨酸PRPP氨基转移酶,青素酸酶,蛋白质酶).
• 这些酶利用β片中的N端残留的侧链作为催化剂的核爱好者.
• 确定的特定核友分别是氨酸,氨酸和三氨酸.

研究的目的:

• 研究这三种胺基酸酶的共同结构特征和催化机制.
• 为了确定一个共同的折叠,负责核友的攻击和潜在的自催化处理.
• 根据结构同质性,建议对这种酶超级家族进行分类.

主要方法:

• 用于确定酶的三维结构的X射线晶体学.
• 进行比较结构分析以识别保存的折叠和活跃的网站架构.
• 生物化学分析以了解催化机制和加工.

主要成果:

• 这三种酶都表现出一种不寻常的,保存的折叠,其中核爱和催化组的位置相当.
• 这种共同的折叠促进了对碳基碳的核友攻击.
• 折叠还支持酶自催化处理的可能性.

结论:

• N-终端核 (Ntn) 酸酶折叠是多种不同的氨基酸酶中常见的结构图案.
• 这个超级家族似乎在进化上是相关的,尽管在序列相似性上有显著的分歧.
• 保存的折叠是催化功能和潜在的自我处理机制的基础.