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在配合环的RNA发针之间形成曲螺旋
J P Marino1, R S Gregorian, G Csankovszki
1Department of Chemistry, Yale University, New Haven, CT 06511, USA.
Science (New York, N.Y.)
|June 9, 1995
概括
ColE1等离子体复制是由RNA I和RNA II调节的. 它们的相互作用形成了一个复合体,由曲螺旋和Rom蛋白稳定,影响等离子体的稳定性.
科学领域:
- 分子生物学分子生物学
- 生物化学 生物化学
- 结构生物学 结构生物学
背景情况:
- 科尔E1等离子体复制依赖于反意义RNA调节器,RNA I和RNA II.
- 最初的相互作用涉及这些RNA转录中的互补循环.
- 由ColE1编码的Rom蛋白调节这种复制过程.
研究的目的:
- 描述互补RNA环之间形成的结构复合体.
- 调查RNA二次结构在反意义调节中的作用.
- 了解Rom蛋白对RNA-蛋白和RNA-RNA相互作用的影响.
主要方法:
- 多维异核磁共振 (2D/3D NMR) 光谱.
- 凝电泳来分析RNA结构和复合物.
- 使用具有七个核酸互补环的模型RNA针头.
主要成果:
- 在互补的RNA循环之间形成了七个基对螺旋.
- 连续螺旋堆叠发生在螺旋茎的3'侧.
- 循环-循环螺旋的急剧曲缩小了主要槽,促进了针头环的闭合.
- 罗马蛋白结合进一步增强了这种结构曲.
结论:
- 过渡复合体构造在结构上是由一个曲的循环-循环螺旋体定义的.
- 观察到的结构特征,包括曲和主要沟狭窄,对于RNA-RNA相互作用和调节至关重要.
- 罗马蛋白结合通过构造变化稳定了调节复合体.