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一个功能多样化的酶超级家族,它抽象了碳酸的α质子
P C Babbitt1, G T Mrachko, M S Hasson
1Department of Pharmaceutical Chemistry, School of Pharmacy, University of California, San Francisco 94143.
Science (New York, N.Y.)
|February 24, 1995
概括
像曼德拉酸赛马酶和粘酸乳酶这样的酶在结构上具有相似之处. 在这个超级家族中,发现了一种新的酶 - - 银酸脱水酶,支持了酶功能的进化假设.
科学领域:
- 生物化学 生物化学
- 酶学 是一种酶学.
- 结构生物学 结构生物学
背景情况:
- 曼德拉酸种族酶和粘酸乳化酶是结构相同的酶,可催化不同的反应.
- 这两种酶家族都通过从碳中提取质子来启动反应.
研究的目的:
- 根据其与曼德拉特种族酶的结构相似性,确定以前未知的基因产品的功能.
- 为了描述这种酶超级家族内的活性位点变异.
主要方法:
- 同类酶的比较结构分析.
- 基于结构同质性的演功能赋值.
- 活跃网站架构的分析.
主要成果:
- 一种新型的酶,银酸脱水酶,通过结构同质性识别到曼德拉酸种族酶.
- 目前在这个酶超级家族中已知有三种不同的活性位点结构 (lysine/histidine,lysine-only,histidine-only).
- 已识别的酶家族催化了从碳中提取质子的过程.
结论:
- 发现银河酸脱水酶扩大了这种酶超级家族中已知的活性位点变异.
- 这一发现支持了这样一个假设:新的酶活性通过招募催化类似化学反应的蛋白质而演变.