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在RNase A中的胺基质子交换中的部分展开的关化诱导
1Department of Biochemistry, Stanford University School of Medicine 94305.
Science (New York, N.Y.)
|November 5, 1993
概括
化甘 (GdmCl) 通过暴露埋藏的表面积,诱导蛋白质在核糖酶A中展开. 这种部分展开机制,以及有限的结构波动,影响了阿米德质子交换率,为蛋白质稳定提供了洞察力.
科学领域:
- 蛋白质生物化学 蛋白质生物化学
- 化学生物学 化学生物学
- 生物物理化学 生物物理化学
背景情况:
- 胺基质子交换率对蛋白质结构和动态敏感.
- 化 (GdmCl) 是一种常见的变质剂,用于研究蛋白质展开.
- 核糖酶A (RNase A) 是一个特征很好的模型蛋白质.
研究的目的:
- 调查瓜尼丁化物 (GdmCl) 是否通过与部分或完全未折叠的核糖酶A (RNase A) 中间体结合来诱导胺质子交换.
- 确定是否可以利用交换反应来研究RNase A.内的局部展开和稳定性.
主要方法:
- 在RNase A中测量23个NH质子的胺 (NH) 质子交换率.
- 瓜尼丁化物 (GdmCl) 的度在0.0~0.7M之间变化.
- 在pH*5.5和34°C的D2O中进行实验.
主要成果:
- 在测试度下,化 (GdmCl) 通过部分展开机制诱导所有23个质子的交换.
- 汇率对GdmCl度的对数曲线的斜率表示暴露的埋藏表面面积的范围.
- 在23个质子中,有9个在较低的GdmCl度下表现出一种称为"有限结构波动"的二次,GdmCl独立的交换机制.
结论:
- 在GdmCl的存在下,胺基质子交换率为研究局部展开事件和RNase A.内特定区域的稳定性提供了一种方法.
- 这些发现支持GdmCl诱导的交换的部分展开机制.
- 有限的结构波动代表了质子交换的替代途径,独立于GdmCl度.