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细菌促进体中的第三个识别元素:由RNA聚合酶的α子单元通过DNA结合
W Ross1, K K Gosink, J Salomon
1Department of Bacteriology, University of Wisconsin-Madison 53706.
Science (New York, N.Y.)
|November 26, 1993
概括
富含AT的DNA序列UP元素通过直接与RNA聚合酶的α子单元相互作用,显著增强细菌的转录. 这种互动对于在标准 -10 和 -35 区域之外的促进者认可至关重要.
科学领域:
- 分子生物学分子生物学
- 遗传学 是一个遗传学.
- 生物化学 生物化学
背景情况:
- 大肠杆菌中的 rrnB P1 促进体含有上游激活 (UP) 元素.
- 这种富含AT的DNA序列增强了RNA聚合酶的转录启动.
研究的目的:
- 研究UP元素刺激转录的机制.
- 为了确定负责UP元素相互作用的RNA聚合酶的特定成分.
主要方法:
- 在RNA聚合酶的α子单元的位点定向突变发生.
- 在体外和体内活体转录试验.
- DNase I 的足迹实验.
- 电泳运动转移试验 (EMSAs) 用于研究蛋白质-DNA相互作用.
主要成果:
- 阿尔法子单元的C端区域的突变取消了UP元素依赖的转录刺激.
- 突变RNA聚合酶在足迹测试中显示,与UP元素的结合减少.
- 纯化α子单位直接与UP元素结合,证实了它在识别中的作用.
结论:
- 该UP元素代表了第三个促进体识别位点,与RNA聚合酶的α子单元相互作用.
- 这种相互作用与西格玛子单位与-10和-35区域的相互作用不同.
- UP 元素可能解释了原生细胞促进体上游富含AT序列的流行,并表明UP 元素功能和转录因子激活之间存在联系.