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在II组内活性位点内的2'-基基的催化作用
D L Abramovitz1, R A Friedman, A M Pyle
1Department of Biochemistry and Molecular Biophysics, Columbia University College of Physicians and Surgeons, New York, NY 10032, USA.
Science (New York, N.Y.)
|March 8, 1996
概括
第二组内 ribozymes 是重要的酶. 研究人员发现,Domain 5上的特定2'-基团对 ribozyme 活性至关重要,影响结合和催化.
科学领域:
- 分子生物学分子生物学
- 生物化学 生物化学
- 在RNA催化过程中.
背景情况:
- II组内 рибо酶是参与RNA剪接的基本遗传元素.
- 域5 (D5) 是 ribozyme 的活性部位的关键组成部分.
- 在D5功能中脊柱替代物的精确作用仍然不完全理解.
研究的目的:
- 为了研究II组内 рибо酶的Domain5内的2"-基组的功能意义.
- 为了区分这些基团对基质结合与催化活性的影响.
主要方法:
- 一系列D5衍生物的合成,在每个位置都包含了脱氧核酸.
- 合成衍生物的动力选,以评估 ribozyme 的活性.
- 竞争性抑制测定和直接动力分析,以区分结合和催化作用.
主要成果:
- 八个2-基团被确定为D5活性的关键.
- 该研究成功地区分了特定的2-基组在结合和催化中的作用.
- 发现基本的2-基位于D5的相反面,表明不同的功能位置.
结论:
- 域5中的特定的2-基团对于II组内核核糖酶功能是不可或缺的.
- 这些基团在分子识别 (结合) 和催化过程中起着不同的作用.
- 这些关键基团的空间排列突出了活性位点内的分子相互作用的特定位置.