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间隔,DNA扭曲,以及对转录的控制
M H Werner1, A M Gronenborn, G M Clore
1Laboratory of Chemical Physics, National Institute of Diabetes and Digestive and Kidney Diseases, National Institutes of Health, Bethesda, MD 20892-0520, USA.
Science (New York, N.Y.)
|February 9, 1996
概括
蛋白质侧链插入DNA,导致结构扭曲,如曲和解,以调节基因转录. 这种涉及疏水性侧链的机制是蛋白质向DNA点招募的关键.
科学领域:
- 分子生物学分子生物学
- 结构生物学 结构生物学
- 生物化学 生物化学
背景情况:
- 转录调节依赖于蛋白质诱导的DNA结构变化.
- 辅助因素曲折或扭曲DNA以促进蛋白质结合.
- 了解这些DNA扭曲对于基因调节研究至关重要.
研究的目的:
- 阐明蛋白质改变DNA的结构机制.
- 在蛋白质-DNA相互作用中识别改变DNA结构的常见主题.
- 探索侧链间隙在DNA螺旋变形中的作用.
主要方法:
- 分析蛋白质-DNA复合体的三维结构.
- 多种蛋白质支架的比较结构分析.
- 保存的分子机制的识别.
主要成果:
- 一个常见的侧链间隙机制驱动DNA螺旋变形.
- 蛋白质支架在结构上是多样化的,有四种不同的拓识别.
- 间接的侧链是完全水的.
- DNA变形包括扭曲,曲,基对脱,以及局部解.
- 扭曲后,B-DNA螺旋参数的恢复迅速发生.
结论:
- 侧链互是蛋白质-DNA复合体中DNA结构调节的保存机制.
- 疏水性相互作用在DNA变形中起着至关重要的作用.
- 蛋白质结构各不相同,但DNA扭曲的功能结果是一致的.