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结合DNA的IRF-1的结构揭示了干扰素调节的决定因素
C R Escalante1, J Yie, D Thanos
1Structural Biology Program, Department of Physiology and Biophysics, Mount Sinai School of Medicine, New York, New York 10029, USA.
Nature
|January 9, 1998
概括
干扰素调节因子 (IRF) 家族.
科学领域:
- 分子生物学分子生物学
- 结构生物学 结构生物学
- 病毒学 病毒学
背景情况:
- 干扰素调节因子 (IRF) 是关键的转录因子,调节干扰素对病毒感染的反应.
- IRF家族是由一个独特的"托团"DNA结合域定义的.
- 了解IRF-DNA相互作用是解读干扰素诱导基因调节的关键.
研究的目的:
- 为了确定IRF-1DNA结合区域的晶体结构.
- 阐明IRF-1与干扰素-β促进剂的PRD I元素结合的分子机制.
- 为IRF家族DNA识别和增强细胞组合提供结构性见解.
主要方法:
- 在X射线晶体学.
- 蛋白质-DNA复杂结构的确定蛋白质-DNA复杂结构的确定
- 结合PRD I DNA的IRF-1的结构分析.
主要成果:
- 确定了与DNA结合的IRF家族成员的第一个3D结构.
- 在IRF-1中发现了一种新的螺旋-转-螺旋动机,利用保存的型酸盐用于DNA结合.
- 该结构揭示了GAAA核心序列的特定识别和由IRF-1诱导的DNA曲.
结论:
- 鉴定的动机和DNA相互作用模式解释了GAAA在IRF响应元素中的重复发生.
- 这些发现为理解更高阶干扰素β增强酶组合提供了结构基础.
- 这项工作提供了关于IRF转录因子在先天免疫中的功能的关键结构信息.