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在RNA折叠中被原生相互作用所捕获的动态中间体.

D K Treiber1, M S Rook, P P Zarrinkar

  • 1Department of Molecular Biology, MB33, Scripps Research Institute, 10550 North Torrey Pines Road, La Jolla, CA 92037, USA.

Science (New York, N.Y.)
|April 16, 1998
PubMed
概括

甲基核糖酶折叠包括动力陷. 破坏原生相互作用的突变通过破坏这些陷来加速P3-P7域的形成,揭示了原生结构作为折叠屏障.

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科学领域:

  • 生物化学 生物化学
  • 分子生物学分子生物学
  • 在RNA生物学,RNA生物学.

背景情况:

  • 离子 (Mg2+) 对于Tetrahymena ribozyme的正确折叠至关重要.
  • 一种特定的动力中间体形成,其中P4-P6域被折叠,但P3-P7域仍然未折叠.

研究的目的:

  • 为了研究阻碍P3-P7域在Tetrahymena ribozyme折叠中形成的动力障碍.
  • 为了确定增强P3-P7域折叠率的突变.

主要方法:

  • 利用体外选择来隔离具有加速P3-P7域折叠率的突变RNA分子.
  • 分析了关键突变对P4-P6域内本地三级相互作用的影响.

主要成果:

  • 确定了在P4-P6域中破坏本地三级相互作用的特定突变.
  • 这些突变显著增加了P3-P7域形成的速度.
  • 动力捕获中间体的不稳定被确定为加速折叠的机制.

结论:

  • 动力陷,由本地RNA相互作用稳定,可以对RNA折叠构成重大障碍.
  • 原生三级相互作用,而不仅仅是错误配对的非原生结构,可以稳定速度限制的动力中间体.