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人类疟疾寄生虫Plasmodium falciparum的染色体2序列
M J Gardner1, H Tettelin, D J Carucci
1Institute for Genomic Research, Rockville, MD 20850, USA.
Science (New York, N.Y.)
|November 6, 1998
概括
菌的染色体2序列揭示了对基因密度和蛋白质结构的洞察力. 这项研究表明,测序疟疾寄生虫的可行性.
科学领域:
- 基因组学就是基因组学.
- 寄生虫学的寄生虫学
- 分子生物学分子生物学
背景情况:
- 疟原虫 (Plasmodium falciparum) 是疟原虫中最致命的一种.
- 了解它的基因组对于开发新的干预措施至关重要.
研究的目的:
- 为了测序和分析Plasmodium falciparum染色体 2.
- 将其基因组特征与其他生物体进行比较.
- 为了识别新的基因家族.
主要方法:
- 整体基因组测序的Plasmodium falciparum染色体 2. 在 2.
- 对基因密度,内子和蛋白质域进行生物信息分析.
- 识别和表征的rifin基因家族.
主要成果:
- 染色体2包含947103个基对和210个预测基因.
- 与Saccharomyces cerevisiae相比,基因密度较低,内核频率增加.
- 发现了rifins,一种可能参与抗原变异的表面蛋白家族.
- 证明了A+T丰富的P. falciparum基因组测序的技术可行性.
结论:
- 杆菌的染色体2具有独特的基因组特征.
- 里芬基因家族是疟疾控制的潜在目标.
- 可以实现Plasmodium falciparum的完整基因组测序.