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虫和酵母的完整蛋白质组的比较:正义学和分歧
S A Chervitz1, L Aravind, G Sherlock
1Department of Genetics, Stanford University School of Medicine, Stanford, CA 94305-5120, USA.
Science (New York, N.Y.)
|December 16, 1998
概括
对比基因组学揭示了酵母和虫Caenorhabditis elegans的核心生物功能依赖于类似的正统蛋白质. 然而,虫的多细胞性与新型蛋白质和扩展的保护域有关,可能定义了元动物.
科学领域:
- 进行比较的基因组学.
- 进化生物学是进化的生物学.
- 分子生物学分子生物学
背景情况:
- 核心生物功能通常在真核生物中得到保存.
- 多细胞性带来了独特的进化挑战,需要新的分子机制.
研究的目的:
- 为了比较Caenorhabditis elegans (多细胞虫) 和Saccharomyces cerevisiae (单细胞酵母) 之间的预测蛋白质序列.
- 确定保存和新型蛋白质和蛋白质域,这些蛋白质域可以解释这些物种之间的复杂性差异.
主要方法:
- 从C. elegans和S. cerevisiae基因组中预测的蛋白质序列的比较分析.
- 识别和比较正体蛋白和保存的蛋白质域.
主要成果:
- 在这两种物种中,大多数核心生物功能都由可比数量的正统蛋白质执行.
- 在C. elegans中的特殊过程,如信号转导和调节控制,利用新型蛋白质,经常重复使用保存的域.
- 在C. elegans中观察到某些保存域的显著扩张,可能有助于多细胞性.
结论:
- 在酵母和虫之间保存的蛋白质很可能在真核生物中具有正系.
- 独特于C. elegans的蛋白质可能是metazoans的特征.
- 虫蛋白中的域扩张可能在多细胞性进化的过程中发挥了作用.