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媒介体和RNA聚合酶II全酶的保存结构
F J Asturias1, Y W Jiang, L C Myers
1Department of Structural Biology, Fairchild Building, Stanford University School of Medicine, Stanford, CA 94305, USA.
概括
媒介体复合体,一个转录调节器,在与RNA聚合酶II相互作用时采用扩展的构造. 这种结构灵活性在真核生物中得到保护,这表明它在基因调节中起着基本作用.
科学领域:
- 分子生物学分子生物学
- 结构生物学 结构生物学
- 生物化学 生物化学
背景情况:
- 转录调节的媒介 (Mediator) 是一个关键的联合激活器复合体.
- 介质与RNA聚合酶II (RNAPII) 相互作用,以调节基因转录.
- 了解调解器的结构及其与RNAP II的相互作用是破译转录控制的关键.
研究的目的:
- 使用电子显微镜可视化介质和RNAP II全酶的结构.
- 在不同条件下和与RNAP II.复合下研究Mediator的构造变化.
- 为了比较不同真核生物物种之间的中间体结构.
主要方法:
- 使用单颗粒电子显微镜 (EM) 绘制介质和RNAP II全酶的图像.
- 使用图像处理技术重建和分析粒子结构.
- 在不同的pH值下和在RNAP II的存在下检查了合规状态.
主要成果:
- 单独的中间体呈现了一个紧的结构.
- 在高pH值或与RNAP II结合时,Mediator表现出扩展的形状.
- 在全酶中,Mediator扩展并部分包裹在RNAP II核心周围,接触点靠近RNAP II C终端域和DNA结合通道.
- 酵母和小鼠中间体复合体表现出类似的结构和形态行为.
结论:
- 介质在与RNAP II相互作用时经历了显著的构造变化.
- 媒介体的扩展形状可能有助于它在转录调节中的作用.
- 介质结构和功能在酵母和哺乳动物之间保持不变,这突出了其在真核转录中的基本重要性.