Implications of using an average relationship matrix in genetic evaluation of a population using multiple-sire...

Ambiguous paternity can be incorporated into the mixed model equations (MME) by including the average numerator relationship matrix (average A), which averages the true sire-offspring relationship over the putative sires. A previous study has shown that some overestimation of genetic trend results from this substitution. A population of 40 breeding females and 2 breeding males was simulated 1000 times with either random mating or sequential selection continuing for eight breeding cycles. In the selection case, candidates were ranked on estimated breeding values (EBVs) calculated from the MME with an animal model and the average A. Variances of the EBVs and prediction errors were computed. The results showed that the average A incorrectly perceives both the variance of family sizes among males and the variance loss due to selection to be smaller. This leads to an overestimation of genetic trend. ZUSAMMENFASSUNG: Auswirkung der durchschnittlichen genetischen Verwandtschaftsmatrix auf die Zuchtwertschätzung in einer Population mit Paarungen mehrerer Vatertiere Zweifelhafte väterliche Abstammung kann in die Mischmodellgleichung (MME) mittels durch- schnittlicher Numerator Verwandtschaftsmatrix (Durchschnitt A) eingebaut werden, die die durchschnittlichen wahren Verwandtschaften der in Frage kommenden Vatertiere beinhaltet. Eine frühere Untersuchung hat gezeigt, daß der genetische Trend dadurch eine gewisse Überschätzung erfährt. Eine Population aus 40 weiblichen und 2 männlichen Zuchttieren wurde 1000 mal simuliert, entweder unter Panmixie oder unter sequentieller Selektion durch acht Zuchtzyklen. Im Selektionsfall wurden die Kandidaten nach dem geschätzten Zuchtwert (EBV) rangiert der aus MME des Tiermodells mit durchschnittlicher A geschätzt worden ist. Varianzen der EBV und Schätzungsfehler wurden berechnet. Es zeigt sich, daß durchschnittliche A die Varianzen der Familiengrößen zwischen Vatertieren und den Varianzverlust durch Selektion als zu gering erfaßt, was zu einer Überschätzung des genetischen Trends führt.