El análisis filogenético basado en secuencias de rRNA apoya el archaebacterial en lugar del árbol eocita

Área de la Ciencia:

• Evolución molecular de la evolución molecular.
• La filogenética es la filogenética.
• La genómica es la genómica.

Sus antecedentes:

• La cuestión fundamental de los linajes primarios de la vida y sus relaciones evolutivas sigue siendo muy debatida.
• Existen dos modelos prominentes: el "árbol arqueobacteriano" (Archaebacteria, Eubacteria, Eukaryotes) y el "árbol de eocitos" (grupo de eocitos con eucariotas).
• El apoyo previo para el árbol de eocitos se derivó de los análisis de pequeñas subunidades de ARN ribosómico (ARNr) utilizando el método de parsimonia evolutiva.

Objetivo del estudio:

• Reevaluar las relaciones evolutivas de los linajes primarios de la vida utilizando métodos filogenéticos robustos.
• Para comparar el rendimiento de diferentes métodos filogenéticos (parsimonia evolutiva, unión de vecinos, parsimonia máxima) en la reconstrucción de árboles evolutivos.
• Para resolver la controversia entre los modelos de árboles arqueobacterianos y eocitales.

Principales métodos:

• Análisis de pequeñas subunidades de secuencias de genes de ARN ribosómico (ARNr) usando métodos de unión de vecinos y de parsimonia máxima.
• Simulaciones por computadora para evaluar la fiabilidad de los métodos filogenéticos en la recuperación de árboles evolutivos conocidos.
• Análisis de grandes secuencias de subunidades de ARNr usando métodos de unión de vecinos, parsimonia máxima y parsimonia evolutiva.

Principales resultados:

• Los análisis de datos de pequeñas subunidades de ARNr utilizando métodos de unión vecina y máxima parsimonia favorecen fuertemente el árbol arqueobacteriano.
• Las simulaciones por computadora demostraron altas tasas de recuperación (>90%) tanto para los árboles arqueobacterianos como para los eocitos utilizando parsimonia vecina y máxima, pero bajas tasas para la parsimonia evolutiva.
• El análisis de las secuencias de ARNr de las subunidades grandes por los tres métodos apoyó inequívocamente el árbol arqueobacteriano.

Conclusiones:

• El árbol arqueobacteriano, que propone Archaebacteria, Eubacteria y Eukaryotes como linajes primarios, está fuertemente respaldado por los análisis filogenéticos actuales.
• El método de parsimonia evolutiva puede ser menos confiable para reconstruir divergencias evolutivas profundas en comparación con la parsimonia de unión vecina y máxima.
• Este estudio proporciona pruebas sólidas que favorecen un modelo específico para la evolución temprana de la vida.