リバーシブルなエネルギー転送スイッチがDNAの支架をオンにします
Magnus Bälter1, Martin Hammarson, Patricia Remón
1Department of Chemical and Biological Engineering, Physical Chemistry, Chalmers University of Technology , 412 96 Göteborg, Sweden.
Journal of the American Chemical Society
|February 18, 2015
まとめ
フォースター共振エネルギー伝送 (FRET) の可逆制御を,パシフィックブルーとAlexa488の染料間で,光色スピロピランを用いて実証しました. 紫外線はスピロピランをスイッチしてFRETを消し,可視光はそれを回復させ,光制御された分子相互作用を可能にします.
科学分野:
- 分子生物学は分子生物学である.
- フォトケミストリー フォトケミストリー
- バイオフィジックス 生物物理学
背景:
- フォースター共鳴エネルギー伝送 (FRET) は,距離に依存する物理プロセスです.
- フォトクロム分子は,光にさらされると,色や形状が変化します.
- 光との分子相互作用を制御することは,高度なアプリケーションにとって極めて重要です.
研究 の 目的:
- DNAの支架上の染料間のFRETの可逆光色制御を調査する.
- FRETの効率を調節するためにスピロピランイソメリゼーションを使用する.
主な方法:
- パシフィックブルー (PB) とアレクサ488 (A488) の染料がDNAの支架に共性的に結合する.
- フォトクロミックスイッチングのためのスピロピラン派生体の組み込み.
- 紫外線と可視光照射下でのFRET効率の変化をモニタリングする.
主要な成果:
- スピロピランが閉じたスパイロ形式であったとき,PBとA488の間のFRETが観察されました.
- スピロピランをオープンメロシアニン形態に紫外線で誘発したイソメリゼーションは,FRETを効果的に滅させました.
- 可視光への曝露はプロセスを逆転させ,スピロピランの再異性化を誘導することによってFRETを復元した.
結論:
- スピロピランのフォトクロミズムは,DNAの支架上のFRETを制御するための可逆的なメカニズムを提供します.
- このライトスイッチ可能なFRETシステムは,分子センシングと論理ゲートにおける潜在的な応用がある.
関連する概念動画
Conservative Site-specific Recombination and Phase Variation
7.4K
Because the DNA segments are cut and reorganized in a direction-specific manner, site-specific recombination has emerged as an efficient genetic engineering technique. Flippase and Cyclization recombinases or Flp and Cre, respectively, are two members of the tyrosine recombinase family derived from bacteriophages, that are used to mediate site-specific DNA insertions, deletions, and targeted expression of proteins in mammalian cell lines.
The recognition sites for Cre recombinase called LoxP...
The recognition sites for Cre recombinase called LoxP...
7.4K
Restarting Stalled Replication Forks
6.6K
DNA replication is initiated at sites containing predefined DNA sequences known as origins of replication. DNA is unwound at these sites by the minichromosome maintenance (MCM) helicase and other factors such as Cdc45 and the associated GINS complex.The unwound single strands are protected by replication protein A (RPA) until DNA polymerase starts synthesizing DNA at the 5’ end of the strand in the same direction as the replication fork. To prevent the replication fork from falling apart,...
6.6K
Gene Conversion
10.9K
Other than maintaining genome stability via DNA repair, homologous recombination plays an important role in diversifying the genome. In fact, the recombination of sequences forms the molecular basis of genomic evolution. Random and non-random permutations of genomic sequences create a library of new amalgamated sequences. These newly formed genomes can determine the fitness and survival of cells. In bacteria, homologous and non-homologous types of recombination lead to the evolution of new...
10.9K
DNA Topoisomerases
38.3K
Topoisomerases are enzymes that relax overwound DNA molecules during various cell processes, including DNA replication and transcription. These enzymes regulate positive and negative DNA supercoiling without changing the nucleotide sequence. DNA overwinding in a clockwise direction results in positively supercoiled DNA, whereas underwinding in a counterclockwise direction produces negatively supercoiled DNA.
Types and Mechanism of action
Topoisomerases are divided into two main types. ...
Types and Mechanism of action
Topoisomerases are divided into two main types. ...
38.3K


