人类和小鼠的条纹性子区域的比较节奏转录组概况
Kaitlyn A Petersen1, Wei Zong2, Lauren M Depoy1
1Department of Psychiatry, Translational Neuroscience Program, Center for Neuroscience, University of Pittsburgh, Pittsburgh, PA, USA.
概括
这项研究揭示了人类和小鼠条体中保存和明显的每日分子节奏. 值得注意的是,人类核内核中的RNA处理节奏在小鼠中没有保存,这表明人类独特的适应.
科学领域:
- 神经科学是一个神经科学.
- 时间生物学 时间生物学
- 分子生物学分子生物学
背景情况:
- 人体的条形体,包括尾状体,面和体核 (NAc),在运动控制,认知和奖励方面发挥作用.
- 之前的研究已经在人类的条纹性子区域中确定了日间RNA转录节奏,使用了一种使用日间RNA转录节奏的方法.
- 这项研究旨在识别和比较小鼠状状子子区域中的分子节奏与人类数据,调查保存和特定物种的模式.
研究的目的:
- 在小鼠的条纹性子区域 (背部中间条纹体,背部侧面条纹体,腹部条纹体) 中识别分子节奏.
- 为了将这些节奏与先前在人类条纹性子区域中识别的昼间节奏进行比较.
- 研究转录组节律的特定物种差异,特别是在RNA处理中.
主要方法:
- 从C57BL/6J小鼠在一天中的6个不同时间收集了条纹子区域.
- 分析RNA转录以确定分子节奏.
- 在小鼠和人类的条形状数据之间比较节奏转录和路径.
主要成果:
- 确定了与细胞压力,能量代谢和人类和小鼠条纹之间的翻译相关的节律转录的显著重叠.
- 发现小核子RNAs (snoRNAs) 和长非编码RNAs (lncRNAs) 在人类NAc中表现出高节律性,这种模式在小鼠中没有观察到.
- 观察到物种之间重叠的节律基因峰值时间的变化,没有一致的方向转移.
结论:
- 人类和小鼠的条纹共享保存的昼间转录组节奏,特别是在代谢和应激反应途径中.
- 在RNA处理中的节奏性,特别是涉及核中snoRNAs和lncRNAs,似乎是一个独特的人类特征.
- 了解这些保存和独特的昼间节律对于理解正常的条纹功能以及它们的破坏对神经系统疾病的潜在影响至关重要.
