标准操作程序与多个LC-MS平台的综合质量控制系统相结合 尿道蛋白质组学
Xiang Liu1, Haidan Sun2, Xinhang Hou1
1School of Biological Science and Medical Engineering & School of Engineering Medicine, Beihang University, Beijing, China.
Nature communications
|January 26, 2025
概括
这项研究介绍了MSCohort,一个尿路蛋白质组的质量控制系统和标准操作程序 (SOP). 它确保在多个液态染色体质谱仪 (LC-MS) 平台上进行可靠和可重复的生物标志物检测,用于精密医学.
科学领域:
- 蛋白质组学是指蛋白质组学.
- 生物标志物发现发现
- 质谱测量质量谱测量
背景情况:
- 尿路蛋白质学提供了非侵入性的生物标志物检测.
- 目前,不同液态染色体质谱仪 (LC-MS) 平台之间的数据可比性有限.
研究的目的:
- 评估不同LC-MS平台的尿蛋白质组数据的可比性.
- 开发一个质量控制 (QC) 系统和标准操作程序 (SOP) 高通量尿蛋白质组分析.
主要方法:
- 开发了MSCohort QC系统,用于评估单个实验和整个队列的81个指标.
- 建立了高通量尿蛋白质组分析的统一SOP.
- 在20个LC-MS平台上使用了数据独立采集 (DIA) 工作流.
主要成果:
- MSCohort QC系统和统一的SOP在多个LC-MS平台上展示了尿液QC样本的高稳定性,灵敏性和可重复性.
- 将SOP应用于基准测试和结直肠癌 (CRC) 样本,在三个LC-MS平台上显示出高量的可重复性和一致的疾病模式.
结论:
- 一个全面的质量控制系统和统一的 SOP 能够在各种LC-MS 平台上实现可靠的,大规模的尿蛋白学.
- 这种标准化促进了多平台临床研究,并推动了精准医学研究.
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