La arquitectura del transcriptoma del SARS-CoV-2

Área de la Ciencia:

• Virología
• Biología molecular
• La genómica

Sus antecedentes:

• El coronavirus 2 del síndrome respiratorio agudo severo (SARS-CoV-2) es el causante de la pandemia de COVID-19.
• El genoma del SARS-CoV-2 es conocido, pero su arquitectura transcriptómica sigue sin caracterizarse en gran medida.

Objetivo del estudio:

• Para crear un mapa de alta resolución del transcriptoma y el epitranscriptoma del SARS-CoV-2.
• Para identificar nuevas transcripciones virales y modificaciones del ARN.

Principales métodos:

• Se utilizó la secuenciación de nanopilas de ADN para analizar la complejidad del transcriptoma.
• Se empleó la secuenciación directa del ARN por nanoporos para identificar modificaciones del ARN.

Principales resultados:

• Descubrió un transcriptoma de SARS-CoV-2 muy complejo con numerosos eventos de transcripción discontinuos.
• ARN genómico canónico identificado, 9 ARN subgenómicos y nuevas transcripciones con ORF desconocidos (fusión, deleción, cambio de marco).
• Se encontraron al menos 41 sitios de modificación de ARN en las transcripciones virales, con AAGAA como el motivo más frecuente. Los ARN modificados exhibieron colas poli-A más cortas.

Conclusiones:

• El transcriptoma del SARS-CoV-2 es más complejo de lo que se entendía anteriormente.
• El descubrimiento de nuevas transcripciones y modificaciones del ARN proporciona nuevas vías para estudiar el ciclo de vida viral y la patogenicidad.
• Las modificaciones del ARN pueden influir en la estabilidad y función del ARN viral.